Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms