Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms