Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms