Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms