Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddx49Q4FZF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms