Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms