Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms