Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrfip1Q3UZ39 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrfip1Q3UZ39 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms