Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trafd1Q3UDK1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms