Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms