Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms