Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTL0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms