Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc4Q3TR08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc4Q3TR08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms