Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp39Q3TIX9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms