Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc69Q3TCJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms