Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim71Q1PSW8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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