Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptcd3Q14C51 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptcd3Q14C51 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms