Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ttc39dQ0VF76 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ttc39dQ0VF76 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ttc39dQ0VF76 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ttc39dQ0VF76 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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