Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hif3aQ0VBL6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms