Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms