Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kndc1Q0KK55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms