Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou6f1Q07916 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms