Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms