Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nfe2Q07279 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms