Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SPINDOCQ05AH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPINDOCQ05AH6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms