Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms