Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tff2Q03404 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms