Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms