Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb5Q02739 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms