Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl31P62900 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl31P62900 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms