Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra1P62812 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms