Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps18P62270 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms