Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnd3P61588 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms