Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Depdc5P61460 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Depdc5P61460 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms