Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp1P59054 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp1P59054 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp1P59054 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp1P59054 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrnp1P59054 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms