Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtdsplP58465 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtdsplP58465 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms