Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RoraP51448 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RoraP51448 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RoraP51448 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RoraP51448 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RoraP51448 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RoraP51448 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RoraP51448 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RoraP51448 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RoraP51448 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RoraP51448 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RoraP51448 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms