Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp3P49194 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp3P49194 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp3P49194 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms