Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3aP46978 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3aP46978 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms