Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LtbP41155 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbP41155 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbP41155 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbP41155 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbP41155 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbP41155 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LtbP41155 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms