Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Timp3P39876 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Timp3P39876 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp3P39876 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms