Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf1P39428 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms