Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtlP38585 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtlP38585 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtlP38585 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TtlP38585 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TtlP38585 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtlP38585 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtlP38585 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms