Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddit3P35639 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms