Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms