Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxa11P31311 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms