Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprmP28828 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprmP28828 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprmP28828 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprmP28828 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms