Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apex1P28352 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apex1P28352 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms