Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PdgfraP26618 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms