Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk11bP24788 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms